本刊前身《生理科学》”于1981年创刊，1984年为国内统一刊物面向全国公开发行，1990年正式改名为“基础医学与临床”，为我国仅有的几份基础医学与临床医学相结合的综合性杂志之一，由北京生理科学会主办。刊物自2005年起改为月刊。每期设专题综述（约请有关专家撰写本专题的现状与最新进展，并紧密结合临床）或医学论坛、学术论文及短文、最新技术与方法等栏目。另新设栏目有：协和CPC、协和内科大查房、临床园  地、医学教育、短篇综述、新闻点击、科普沙龙。现为北京市优秀期刊及中国自然科学核心期刊。《基础医学与临床》（月刊）创刊于1981年，由北京生理科学会主办，中国医学科学院、中国协和医科大学基础医学研究所和北京协和医院共同承办，为我国目前仅有的以基础研究与临床医学相结合为主要宗旨的综合性刊物。 《基础医学与临床》主要栏目有：研究论文、专家述评、专题综述、医学论坛、短篇综述、技术与方法、研究短文、协和大查房、临床园地、协和CPC、医学教育、系列讲座以及科普沙龙、新闻点击等。协助广大临床医学工作者启发科研思路，为读者提供医学科学研究全方位、多视角的最新信息和交流平台。现为中国科技核心期刊和中国医药卫生核心期刊，被国内众多重要的检索系统及其数据库收录。2004年入选《中国科技期刊科技精品库》。2006年~2008年入选中国科协2006年度精品科技期刊工程资助项目（C类）。 《基础医学与临床》被北大1992版核心期刊、北大1996版核心期刊、北大2000版核心期刊、北大2004版核心期刊、北大2008版核心期刊，是1991年北京市优秀期刊称号；2004年中国自然科学核心期刊；2004年入选《中国科技期刊科技精品数据库》；2006-2008年中国科协精品科技期刊工程资助项目（C类）。